Primero año aceptable
El desempeño de Jonathan tras su aterrizaje en Villarreal, había sido constante, disputando 23 partidos, 17 de ellos como titular, entregando un buen nivel, su único enemigo fueron las lesiones, que lo alejaron varias fechas, a pesar de ello, se ganó la confianza de su Técnico quien lo tenía constantemente en la plantilla, en especial, durante partidos de Europa League, donde le vimos mejor rendimiento, incluso llegando a marcar goles, cualidad que es un plus para la posición donde se ubica, registrando, al final de la campaña, dos anotaciones.